El Proyecto Genoma Humano
(P.G.H) es un proyecto internacional, que partió el año 1988, cuyo objetivo principal
es conocer la secuencia completa del genoma humano (1, números referentes a blibliografía).
Se llama genoma a la totalidad
del material genético de un organismo. El genoma humano posee entre 50.000 y 100.000
genes distribuidos entre los 23 pares de cromosomas de la célula somática humana. Cada
cromosoma puede contener más de 250 millones de pares de bases de DNA, y se estima
que la totalidad del genoma humano tiene 3000 millones de pares de bases (2). La
idea de iniciar un estudio coordinado del genoma humano surgió de una serie de
conferencias científicas celebradas entre 1985 y 1987; idea que ganó impulso en
Estados Unidos en 1990 con la ampliación de la financiación del Departamento de
Energía (D.O.E), y la posterior unión al proyecto de los Institutos Nacionales
de Salud (N.I.H). Uno de los primeros directores del programa en Estados Unidos
fue el bioquímico James Watson, que en 1962 junto con el biofísico Francis Crick,
recibieron el Premio Nobel de Fisiología y Medicina por el descubrimiento de la
estructura del DNA (2). Estructura
del DNA Comenzando los años 50, J.
Watson y F. Crick se unieron en el trabajo de dilucidar la estructura del DNA.
La estructura tenia que permitir: - que
la molécula de DNA portara información
-
que la molécula de DNA pudiera autoduplicarse. Según
el modelo propuesto por Watson y Crick, la molécula de DNA consta de dos columnas
hechas de grupos fosfato, alternados con moléculas de desoxirribosa, las cuales
forman dos hebras paralelas que están enrolladas como una hélice, dejando las
bases nitrogenadas hacia adentro. Las bases nitrogenadas son adenina la que se
aparea con timina y citosina con guanina (o viceversa).(3). Este tipo de asociación
entre las dos cadenas del DNA le confiere dos características importantes: -
las dos cadenas son complementarias y también antiparalelas (4). El
código genético, entonces, viene determinado por el orden que ocupan las bases
en la escalera de DNA. Por lo general cada sección de esta escalera tiene una
secuencia única que puede utilizarse para diferenciar unos genes de otros y fijar
su posición en el cromosoma (2). La siguiente imagen corresponde al supuesto modelo
de la cadena de DNA.
Cartografía y Secuenciación El
P.G.H., al tratarse de un proyecto que pretende identificar la secuencia completa
del genoma humano, con toda una secuencia codificante (exones) y no codificante
(intrones), necesita de técnicas que permitan identificar el lugar (locus) y la
distancia en que se encuentran los más de 100.000 genes. En
un principio, el P.G.H. fue acordado realizarlo en dos etapas, una de Mapeo físico
(o cartografía genética) de todos los cromosomas, etapa que termino el año 1998;
luego, la segunda etapa corresponde a Secuenciación, la que partió en 1998 (1). Hay
dos categorías principales de técnicas de cartografía genética: Ligamiento o cartografía
genética. que identifica sólo el orden relativo a los genes a lo largo del cromosoma;
y Cartografía física,un conjunto de métodos más precisos que permite determinar
las distancias entre genes dentro del cromosoma. ambos tipos de cartografía utilizan
marcadores genéticos, que son características físicas o moleculares detectables
que se diferencian entre los individuos y se transmiten por herencia (2). Los
mapas de ligamiento humano se han elaborado sobre todo siguiendo las pautas de
herencia de familias extensas a lo largo de muchas generaciones. Estos estudios
se limitan a los rasgos físicos heredados, fácilmente observables en todos los
miembros de la familia. La cartografía
física determina la distancia real entre puntos diferenciados de los cromosomas.
Las técnicas más precisas combinan robótica, uso de láser e informática para medir
la distancia entre marcadores genéticos. Para realizar estos mapas se extrae DNA
de los cromosomas humanos y se rompe aleatoriamente en numerosos fragmentos (2). Una
de las estrategias para lograrlo consiste en utilizar secuencias de DNA complementarias
(cDNA). Estas secuencias se obtienen gracias al uso de una proteína de origen
viral (transcriptasa inversa) que es capaz de copiar una molécula de DNA a partir
de una molécula de RNA. Debido a que el RNA pierde todas las secuencias no codificantes
(intrones) durante su paso desde el núcleo al citoplasma, al utilizarlo como "modelo"
uno se asegura que el DNA obtenido de ese RNA ( o cDNA ) posee sólo genes "útiles"
o codificantes. Posteriormente las secuencias se amplifican cientos de veces en
un sistema de "copia automática" conocido como reacción de polimerasa en cadena
(PCR), con lo cual se obtienen cientos de fragmentos de la secuencia deseada en
pocas horas. Finalmente estas secuencias pueden ser sometidas a las distintas
estrategias de mapeo que existen en la actualidad (5). La
secuenciación es el proceso por el cual se identifican las secuencias en que están
unidas los 300 mil millones de pares de bases y luego, posteriormente, saber que
significan estas secuencias. Para
determinar la secuencia real de nucleótidos, hacen falta mapas físicos muy detallados
que recojan el orden exacto de las piezas clonadas del cromosoma. El método por
el cual se secuencia el DNA, consiste en replicar piezas específicas de DNA y
modificarlas de modo que terminen en una forma fluorescente de uno de los cuatro
nucleotidos. En los modernos secuenciadores automáticos de DNA, el nucleótido
modificado situado al extremo de una de estas cadenas se detecta con un haz de
láser y se determina el numero exacto de nucleótidos de la cadena a continuación
se combina esta información en un ordenador para reconstruir la secuencia de pares
de bases de la molécula original de DNA (2). El
ritmo de acumulación de secuencias de DNA es vertiginoso ya que su cantidad se
dobla cada pocos meses. Actualmente se estima que ya se ha secuenciado casi un
dos por ciento del total del genoma humano, pero este dato no debe engañar: con
las técnicas y ritmos actuales, en los próximos años se obtendrá una tasa de 500
Mb por año. La siguiente imagen corresponde a un mapa genético del genoma humano.
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